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環狀RNA芯片定制檢測服務
產品編號:PR0066229
別名  
英文名  
環狀RNA芯片定制檢測服務
提供商:         上海研謹生物
服務名稱:      環狀RNA芯片定制檢測服務
規格:             實驗服務
價格:          1000元
收費標準/服務周期/提供結果:
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環狀RNA芯片定制檢測服務
 
 
實驗技術簡介: 環狀RNA (ircRNA) 是區別于傳統線性RNA的一類新型RNA,具有閉合環狀結構,大量存在于真核轉錄組中。大部分的環狀RNA是由外顯子序列構成,在不同的物種中具有保守性,同時存在組織及不同發育階段的表達特異性。由于環狀RNA對核酸酶不敏感,所以比線性RNA更為穩定, 這使得環狀RNA在作為新型診斷標記物的開發應用上具有明顯優勢。近來研究顯示,環狀RNA在不同物種中起到miRNA海綿的作用,稱之為競爭性內源RNA (ceRNA) , 能競爭性結合miRNA。而與疾病關聯性miRNA的相互作用說明環狀RNA對疾病的調控起著非常重要的作用。
 
實驗操作流程:
1、樣品RNA抽提
2、RNA質量檢測
①使用Nanodrop測定RNA在分光光度計260nm、280nm和230nm的吸收值,以計算濃度并評估純度。
②用甲醛電泳試劑進行變性瓊脂糖凝膠電泳,檢測RNA純度及完整性。
③提供RNA QC報告。
3、RNase R處理
4、cDNA/aRNA樣品合成和標記
5、標記效率質量檢測使用Nanodrop檢測熒光標記效率,標記效率合格以保證后續芯片實驗結果的可靠性。
6、芯片雜交
在標準條件下將標記好的探針和高密度基因組芯片進行雜交。
7、圖像采集和數據分析
使用GenePix 4000B芯月掃描儀掃描芯片的熒光強度,并將實驗結果轉換成數字型數據保存,使用配套軟件對原始數據進行分析運算。
8、提供實驗報告
①Scanning Image: Cy3熒光掃描圖像;
②Scatter Plot:散點圖,X軸為Control信號值,Y軸為Experiment信號值, 表示信號數據總體分布趨勢;
③Raw Data:探針的掃描熒光信號強度原始數據;
④Normalized Data:經過統計學方法標準化后數值;
⑤P-value: T-test統計分析顯著差異表達的基因,p-value越小, 該circRNA在兩組樣本間差異表達越顯著
⑥significant Up & Down Regulated CircRNA List:顯著差異表達的circRNA列表包含Fold Change, p-valuel以及circRNA的詳細注釋信息(相應的線性mRNA和miRNA結合位點)。
 
客戶提供:
1、實驗對象為組織樣品,取適量(50-100mg) 新鮮組織樣品或正確保存的組織樣品,使用
BioPulverizer TM冰凍粉碎組織,加1m的RNA抽提試劑TRIzol (Invitrogen) ,使用Mini-Bead-Beater-16勻漿后抽提RNA。
2、實驗對象為細胞樣品,每份樣品取1x106~ 1x107細胞,加1m的RNA抽提試劑TRIzol (樣品為貼壁細胞,每10cm2培養皿TRIzo1使用量為1ml),裂解后抽提RNA。
交付標準:
1、芯片檢測數據
2、完整的實驗操作規程、實驗報告(含軟件分析結果)以及實驗材料
 
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實驗代做:
Elisa免費代做 Wb代做 蛋白芯片定制 石蠟冰凍切片
HE染色 透射電鏡 掃描電鏡服務 免疫共沉淀
流式細胞分選 CCK8檢測代做 組織芯片微陣列 免疫細胞化學ICC
熒光染料標記 油紅O染色 免疫熒光染色 免疫共沉淀(Co-IP)實驗
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